- h -
- hasBootstrapValue()
: bpp::Node
- hasBranchProperty()
: bpp::Node
, bpp::TreeTemplate< N >
, bpp::Tree
- hasDistanceToFather()
: bpp::Node
, bpp::Tree
, bpp::TreeTemplate< N >
- hasExclusivePaths()
: bpp::MixedSubstitutionModelSet
- hasFather()
: bpp::Node
, bpp::Tree
, bpp::TreeTemplate< N >
- hasListenerFor()
: bpp::TreeDrawingDisplayControler
- hasMixedSubstitutionModel()
: bpp::SubstitutionModelSet
- hasName()
: bpp::Node
- hasNext()
: bpp::AbstractNonHomogeneousTreeLikelihood::ConstNonHomogeneousSiteModelIterator
, bpp::AbstractTreeLikelihood::SimpleBranchIterator
, bpp::AbstractTreeLikelihood::SimpleSiteIterator
, bpp::AbstractTreeLikelihood::ConstNoPartitionBranchModelIterator
, bpp::TreeLikelihood::BranchIterator
, bpp::TreeLikelihood::SiteIterator
, bpp::TreeLikelihood::ConstBranchModelIterator
, bpp::TreeLikelihood::ConstSiteModelIterator
, bpp::AbstractHomogeneousTreeLikelihood::ConstHomogeneousSiteModelIterator
- hasNode()
: bpp::Tree
, bpp::TreeTemplate< N >
- hasNodeName()
: bpp::Tree
, bpp::TreeTemplate< N >
- hasNodeProperty()
: bpp::Node
, bpp::Tree
, bpp::TreeTemplate< N >
- hasNodeWithId()
: bpp::TreeTemplateTools
- hasNodeWithName()
: bpp::TreeTemplateTools
- hasRateDistribution()
: bpp::DistanceEstimation
- hasSameTopologyAs()
: bpp::TreeTemplate< N >
- hasSubstitutionModel()
: bpp::DistanceEstimation
- hasSubstitutionRegister()
: bpp::AbstractSubstitutionCount
, bpp::SubstitutionCount
- hasTree()
: bpp::TreeDrawing
, bpp::AbstractTreeDrawing
- hasWeights()
: bpp::WeightedSubstitutionCount
, bpp::AbstractWeightedSubstitutionCount
- haveSameElementsThan()
: bpp::BipartitionList
- haveSameOrderedTopology()
: bpp::TreeTemplateTools
- haveSameTopology()
: bpp::TreeTools
- HierarchicalClustering()
: bpp::HierarchicalClustering
- HKY85()
: bpp::HKY85
- HomogeneousSequenceSimulator()
: bpp::HomogeneousSequenceSimulator
- HyperNode()
: bpp::MixedSubstitutionModelSet::HyperNode